Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TefQ9JLC6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms