Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ybx3Q9JKB3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ybx3Q9JKB3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms