Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK53

Prelp, Prolargin, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrelpQ9JK53 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrelpQ9JK53 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrelpQ9JK53 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms