Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms