Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms