Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EefsecQ9JHW4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms