Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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