Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod3Q9JHJ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod3Q9JHJ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod3Q9JHJ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmod3Q9JHJ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmod3Q9JHJ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmod3Q9JHJ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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