Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rb1cc1Q9ESK9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms