Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LrbaQ9ESE1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LrbaQ9ESE1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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