Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms