Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms