Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms