Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpsf1Q9EPU4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpsf1Q9EPU4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms