Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sil1Q9EPK6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sil1Q9EPK6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sil1Q9EPK6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sil1Q9EPK6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sil1Q9EPK6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sil1Q9EPK6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms