Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Foxp4Q9DBY0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxp4Q9DBY0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms