Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms