Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rexo2Q9D8S4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rexo2Q9D8S4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms