Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmigd1Q9D7L8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms