Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms