Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms