Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms