Protein–RNA interactions for Protein: Q9D476

4933407L21Rik, RIKEN cDNA 4933407L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933407L21RikQ9D476 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933407L21RikQ9D476 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933407L21RikQ9D476 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4933407L21RikQ9D476 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms