Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rsph14Q9D3W1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rsph14Q9D3W1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms