Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx29Q9D3S3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx29Q9D3S3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms