Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd3Q9D176 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms