Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed3Q9D0L1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed3Q9D0L1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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