Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc47Q9D024 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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