Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc77Q9CZH8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc77Q9CZH8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc77Q9CZH8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc77Q9CZH8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc77Q9CZH8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc77Q9CZH8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc77Q9CZH8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms