Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Prdm5Q9CXE0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prdm5Q9CXE0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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