Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Utp23Q9CX11 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms