Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkrip1Q9CWV6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms