Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tdrd12Q9CWU0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tdrd12Q9CWU0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms