Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NubplQ9CWD8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms