Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms