Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem42Q9CR22 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms