Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rer1Q9CQU3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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