Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PompQ9CQT5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PompQ9CQT5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms