Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RTRAFQ9CQE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RTRAFQ9CQE8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RTRAFQ9CQE8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RTRAFQ9CQE8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTRAFQ9CQE8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RTRAFQ9CQE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RTRAFQ9CQE8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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