Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ergic3Q9CQE7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms