Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp2Q9CQ73 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp2Q9CQ73 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.9 ms