Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms