Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl17Q9CPR4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl17Q9CPR4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms