Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrbp1Q99PL5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrbp1Q99PL5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrbp1Q99PL5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrbp1Q99PL5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrbp1Q99PL5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrbp1Q99PL5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms