Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc26a5Q99NH7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms