Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rad54l2Q99NG0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad54l2Q99NG0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms