Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrrtQ99MR6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms