Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KarsQ99MN1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KarsQ99MN1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms