Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1b4Q99ME6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1b4Q99ME6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms