Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gins4Q99LZ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms